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“基于转录组测序的肝癌恶性进展与肿瘤免疫微环境的相关分子机制研究”通知

  项目背景

  1.国内外研究现状:原发性肝癌(HCC)在世界范围内持续受到广泛关注,其复杂的发病机制和治疗难题使其成为肿瘤学和临床医学的重要研究领域1。在我国,HCC的问题尤为严重。高发病率和高死亡率使得这一恶性肿瘤成为引起广泛关注的国家级公共卫生难题。随着科技的进步,全球多个生物医学研究中心和专门的生物信息学数据库,如The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Gene Expression Omnibus (GEO),已经收集和整理了大量的肝癌相关基因表达和突变数据,为深入理解HCC的分子生物学基础铺平了道路2。在生物医学技术飞速发展的背景下,早期HCC的诊断和治疗技术也有了显著进步。多种治疗策略例如肝脏切除、射频消融和动脉化疗栓塞等在早期HCC患者中展示了其有效性,帮助患者获得了更高的生存率和更好的生活质量。然而,中晚期HCC患者仍面临着巨大的治疗挑战3。复杂的病理生理特征,如大血管癌栓的形成、多发病灶的出现等,使得传统的治疗策略在这一阶段常常变得无效或效果有限。

  2.研究意义:肝癌的治疗瓶颈,特别是对于中晚期患者,要求我们必须从更深层次、更细微的角度去探讨其发病机制和治疗策略。分子生物学、基因组学和转录组学为我们提供了这样的工具和视角。鉴定肝癌进展及其对治疗响应的生物标志物,有望为患者提供更为个性化、精准的治疗方案。此外,随着免疫治疗在多种恶性肿瘤中的应用及其取得的明显疗效,如何准确评估肝癌患者对免疫治疗的响应,成为目前研究的关键问题。

  3.拟解决的关键问题: 

  我们希望,通过本项目的深入研究,能够为肝癌的早期诊断、治疗评估以及个体化治疗策略选择提供坚实的科学依据,从而推动肝癌的精准医疗进程。为了给患者提供更佳的健康服务,响应国家不断深入并提升医疗水平的精神。北京医学奖励基金会特设立基于转录组测序的肝癌恶性进展与肿瘤免疫微环境的相关分子机制研究”项目。

  项目内容

  本研究项目将着重利用多种高通量生物信息学手段,对TCGA肝癌队列中的371例LIHC患者数据进行全面、精确的分析。我们将整合基因表达、突变频率、甲基化和其他相关的组学数据,以捕获更全面的生物信息。利用TIDE和其他相关的生物信息学算法,我们将评估每一位患者对免疫治疗的潜在反应性5。这一过程不仅将对每个患者进行预测评分,更重要的是,通过模型,我们将试图揭示驱动这些反应的分子和细胞机制。基于免疫治疗的潜在反应性评估,我们将进一步鉴定应答和非应答患者群体之间的DEGs。为此,我们将利用LASSO回归、SVM-RFE以及其算法,确保从这些DEGs中准确筛选出与免疫治疗响应密切相关的关键特征基因。基于上述筛选出的关键特征基因,我们将开发一个精准的免疫治疗反应预测模型。为确保模型的可靠性和普适性,我们将对模型进行大规模的外部验证。在模型验证后,我们将进一步与临床团队密切合作,将这些关键特征基因转化为实用的临床检测工具或套件,以期为医生提供实时、准确的决策支持。

  项目对象

  1.对TCGA的肝癌队列中371例LIHC患者的免疫治疗反应进行深入评估。

  2.鉴定免疫治疗应答者与非应答者之间的差异表达基因(DEGs)。

  3.采用先进的生物信息学算法筛选与肝癌免疫治疗反应相关的关键特征基因。

  项目时间

  2023年11月至2026年11月

  项目联系人

  朱少敏 联系电话:15010624992

北京医学奖励基金会

2023年10月

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